În anul 2005, în judeţul Mureş au fost eliminate prin arderea în crematoriile existente 752,9 t de deşeuri periculoase rezultate din activităţi medicale. Din activităţile de ocrotire a sănătăţii sau din activităţile veterinare rezultă deşeuri periculoase şi nepericuloase.

O problemă ce pare a fi mai greu rezolvată, cu privire la gestionarea deşeurilor medicale periculoase este reprezentată de eliminarea finală. În judeţul Mureş, eliminarea finală a deşeurilor periculoase se realizează prin arderea în crematorii. Aceste instalaţii sunt rudimentare, prezentând o serie de inconveniente (ex: arderea nu este completă, se realizează la temperatură scăzută ceea ce duce la emisii poluante atât pentru mediu cât şi pentru sănătatea populaţiei din zonă). În scopul rezolvării acestei probleme, prin Protocolul încheiat între Ministerul Mediului şi Gospodăririi Apelor, Ministerul Sănătăţii şi Garda Naţională de Mediu, pentru conformarea unităţilor sanitare generatoare de deşeuri medicale periculoase s-a stabilit un program de închidere etapizată a crematoriilor. Conform acestui program un număr de 5 crematorii din cele 6 din judeţul Mureş îşi vor sista activitatea de incinerarea deşeuri, medicale infecţioase în cursul anului 2006. După închiderea crematoriilor deşeurile medicale vor trebui transportate la unităţi de incinerare autorizate. Din informaţiile existente până în prezent, "Fondul pentru mediu" nu va finanţa nici o unitate de incinerare pentru deşeuri periculoase în judeţul Mureş aşa că acestea vor trebui transportate la unităţi de incinerare din alte judeţe. Transportul deşeurilor periculoase se poate face numai de către firme autorizate. În judeţul Mureş sunt autorizate pentru transportul rutier al deşeurilor periculoase din sectorul medical SC Profi Trans SRL Cristesti şi SC Europlus GRUP SRL Târgu Mureş, iar SC Ecorom SRL Târgu Mures este în curs de autoriza