În judeţul Mureş, eliminarea finală a deşeurilor periculoase din sistemul medical se realizează în prezent prin arderea în crematorii. Din cele şase crematorii existente în judeţul Mureş, în anul 2006 sunt propuse pentru sistarea activităţii cinci, ale spitalelor din Reghin, Târnăveni, Luduş şi a doua spitale din Sighişoara, rămânând în funcţiune doar cel aparţinător Spitalului Clinic Judeţean Mureş, care îşi va înceta activitatea în anul 2007. }inând seama de cele menţionate şi de timpul rămas până în 31 decembrie, unităţile spitaliceşti vizate au fost informate cu privire la documentaţia necesară obţinerii avizului de mediu la încetarea activităţii de eliminare a deşeurilor în crematorii. De asemenea, cabinetele medicale au fost înştiinţate să ia măsuri în vederea colectării, transportului şi eliminării deşeurilor medicale periculoase rezultate din activitatea unităţii prin societăţi autorizate pentru desfăşurarea acestor activităţi. În judeţul Mureş funcţionează 9 depozite de deşeuri municipale şi asimilabile, având suprafaţa de 21,46 ha şi 9 depozite de deşeuri de producţie având o suprafaţă ocupată de 62 ha.
Conform inginerului Cosmina Uleşan, de la Agenţia pentru Protecţia Mediului Mureş, în judeţ îşi vor sista activitatea de depozitare în următorii ani mai multe depozite :
* Depozitul de deşeuri menajere Luduş în anul 2007,
* Depozitul de deşeuri menajere Sovata în anul 2008,
* Depozitul de deşeuri menajere Târnăveni în anul 2008,
* Depozitul de deşeuri menajere Iernut în anul 2008,
* Depozitul de deşeuri menajere Târgu Mures în anul 2009,
* Depozitul de deşeuri menajere Reghin în anul 2009,
* Depozitul de deşeuri industriale periculoase SC Azomureş SA – 2006,
* Depozitul de deşeuri industriale periculoase SC Bicapa SA în anul 2006
* Depozitul de deşeuri industriale nepericuloase şi inerte SC Aqu