În 2005, Neculai Poalelungi, actual consilier audit al Arhiepiscopiei, s-a luat la bătaie cu un alt preot, în birourile bisericii * Maria Dumitrescu a rămas fără casă în urma intervenţiilor preotului Petru Restanţia din Mangalia, membru al Consistoriului Eparhial
Patru preoţi ai Arhiepiscopiei Tomisului au înaintat un memoriu către Patriarhul Daniel, prin care solicită anularea deciziei de caterisire care s-a făcut în mod ilegal. Trei dintre ei au mers mai departe şi au depus şi plângere la Direcţia Naţională Anticorupţie.
Marius Mustaţă, fost protoiereu de Băneasa, şi soţia sa, ex-juristă a Înalt Preasfinţiei Sale Teodosie, au fost primii care au avut curajul de a divulga aspecte deloc ortodoxe din sânul Arhiepiscopiei. Cei doi, alături de Vasile Guriţă şi fiul său - Ciprian, foşti preoţi la Biserica Naşterea Domnului din Eforie Nord, se constituie părţi vătămate în dosarul penal 266/P/2007 de la Direcţia Naţională Anticorupţie (DNA). În acest dosar, arhiereul este acuzat de abuz în serviciu şi acte grave de corupţie. Preotul militar Traian Chircu, singura faţă bisericească din ţară onorată cu Crucea Patriarhală, semnează, alături de preoţii Guriţă şi Mustaţă, memoriul depus la Patriarhia Română. El nu a făcut încă plângere la DNA, însă consilierul bisericii, da. Ioan Ababei spune că în data de 5 martie 2009 a făcut plângere penală la DNA, din cauza modului abuziv în care a fost trecut lăcaşul de cult „Adormirea Maicii Domnului" din subordinea Armatei în cea a Arhiepiscopiei de către „oamenii lui Teodosie".
Înlocuiţi de consilierul juridic al Arhiepiscopiei
Primul preot căruia i-a fost interzis să mai fie slujitor al Domnului este pr. Marius Mustaţă. În primăvara lui 2008, s-a reunit Consistoriul Eparhial şi l-a caterisit pentru nereguli administrative. Pe 19 februarie 2009, acelaşi tribunal bisericesc se reunea pen