Procesul de epurare a apelor uzate va cunoaşte îmbunătăţiri majore în urma lucrărilor prevăzute în proiectul ISPA, noile tehnologii şi calitatea superioară a apei întoarsă în natură după folosirea acesteia de către botoşăneni având un impact pozitiv asupra mediului.             Astfel, în treapta mecanică de epurare, care constă la ora actuală în folosirea unor grătare situate în aer liber şi a unui operator care trebuie mereu să le cureţe pentru a scoate deşeurile solide din apa de canal, va fi realizată o incintă închisă, cu grătare automatizate. Depunerile vor fi compactate în containere fără intervenţia directă a muncitorului. Prin urmare va dispărea mirosul neplăcut din atmosferă, echipamentul automat nemaipunând în pericol sănătatea operatorului.             În ceea ce priveşte etapele ulterioare de epurare, proiectul va aduce înlocuirea aeratoarelor mecanice folosite în prezent cu un sistem de difuzare în apă a oxigenului, monitorizat electronic, astfel încât să se permită în final extragerea unei mari cantităţi de amoniac, oxigenare şi modificarea PH-ului apei uzate. Totodată se creează condiţiile pentru ca într-o etapă viitoare să se extragă şi fosforul, toate îmbunătăţirile făcând ca apa reîntoarsă în natură să nu fie nocivă peştilor şi vegetaţiei.             Pe linia nămolului extras din apele ieşite din sistemul de canalizare, lucrările finanţate de Uniunea Europeană presupun echipamente noi ce vor permite eficientizarea producerii de biogaz precum şi generarea energiei electrice ce va acoperi, spre exemplu la Răchiţi, 90% din necesarul staţiei de epurare. După această etapă nămolul va fi uscat, i se va reduce de 30 de ori volumul, iar în funcţie de analizele de laborator, pământul rezultat va putea fi folosit în agricultură, depus în groapa ecologică a judeţului sau incinerat. În prezent acesta este deshidratat şi depus pe nişte paturi de nă