În urma demersurilor fundaţiei constănţene ce poartă numele mitropolitului, Sfântul Sinod al Bisericii Ortodoxe Române a decis canonizarea lui Andrei Şaguna şi sărbătorirea lui pe 30 de noiembrie.
Biserica Ortodoxă Română a stabilit ritualurile şi slujba de cinstire a Sfântului Mare Ierarh Andrei Şaguna, icoana, acatistul şi rugăciunea sfântului. În slujba de pomenire, acesta este numit „Andrei cel Mare şi Sfânt, păstorul cel bun şi înţelept”, iar rugăciunea îl invocă pe sfânt ca „neînfricat apărător al ortodoxiei, înţelept teolog al adevărului mântuitor, cunoscător şi tâlcuitor al Sfintelor Scripturi, lumină aprinsă din lumina lui Hristos”. Preşedintele Comisiei Sinodale pentru canonizarea Sfinţilor Români, IPS Mitropolit Dr. Laurenţiu al Ardealului consideră că Andrei cel Mare şi Sfânt este un „sfânt al Ortodoxiei ecumenice”, iar acatistul ne îndeamnă „să-i aducem laude ca unui nou apostol al lui Hristos” pentru toate faptele sale care au întărit Biserica Ortodoxă Română. Demersurile pentru canonizarea mitropolitului au fost iniţiate de Universitatea Andrei Şaguna Constanţa încă din anul 1993. Pentru rolul important pe care l-a avut în dezvoltarea educaţiei, vieţii spirituale şi culturii, UNESCO a declarat anul 2008, în care s-au împlinit 200 de ani de la naşterea Marelui Ierarh, „Anul Şaguna”. „Sfântul Andrei Şaguna face parte dintr-un lung şir de monahi aromâni, figuri reprezentative ale bisericii ortodoxe, care demonstrează vocaţia spirituală a acestei ramuri a poporului român: Sfânta Paraschiva, Mitropolitul Dosoftei, Atenagoras - Patriarhul Ecumenic al Constantinopolului, ilustrul teolog Andrei Scrima, Sfântul Iosif cel Nou de la Partoş – Ocrotitorul Banatului, Maica Tereza şi Arsenie Papacioc, a cărui canonizare cât mai grabnică a adăstăm“, a declarat Aurel Papari, rectorul Universităţii constănţene Andrei Şaguna.