Premierul Victor Ponta şi-a trecut în subordonare directă, prin Ordonanţa de Urgenţă privind reorganizarea Guvernului, DGIPI (fostul serviciu secret "Doi şi-un sfert"), Autoritatea Naţională pentru Restituirea Proprietăţilor, dar şi alte instituţii care se aflau în Cabinetul Ponta I în coordonarea altor ministere. Înaintea votului de învestitură primit de Guvernul Ponta II între liberali şi social-democraţi s-au purtat negocieri dure în privinţa atribuţiilor care revin fiecărui minister. Câştigătorul negocierilor este chiar premierul Victor Ponta, care şi-a trecut în subordine mai multe instituţii cheie. După ce Liviu Dragnea a cerut ca prefecturile să treacă la Ministerul Administraţiei, iar liberalii s-au opus vehement, soluţia finală îl avantajează pe primul-ministru. În Ordonanţa de organizare a Guvernului, la articolul 3 se prevede că „instituţia prefectului funcţionează în subordinea şi în coordonarea primului-ministru”, dar finanţarea este asigurată prin bugetul Ministerului Afacerilor Interne, condus de Radu Stroe (PNL). Tot din curtea liberalilor, premierul a luat şi DGIPI, numirea şefilor acestei instituţii revenind tot premierului. „Direcţia generală de informaţii şi protecţie internă din cadrul Ministerului Administraţiei şi Internelor se reorganizează ca departament în cadrul Ministerului Afacerilor Interne, coordonat de un secretar de stat, ajutat de doi subsecretari de stat, numiţi şi eliberaţi din funcţie prin decizie a primului-ministru”, se precizează la articolul 22 din OUG. Şefia DGIPI a fost un subiect delicat şi în guvernarea PSD - PDL când PSD a insistat să aibă Ministerul de Interne, doar pentru a avea acces la acest serviciu secret, fostul Doi şi-un sfert. Numirea şefilor de la acest serviciu a dus la schimbarea a doi miniştri de Interne, Gabriel Oprea şi Liviu Dragnea, care au refuzat să asculte comenzile fostei conduceri a PSD. O altă insti