Curtea de Apel Târgu Mureş a interzis utilizarea steagului secuiesc în judeţul Harghita, după ce, un reclamat a dat în judecată Consiliul Judeţean (CJ) Harghita pentru adoptarea steagului secuiesc ca steag al judeţului.
În 22 noiembrie 2009, CJ Harghita a aprobat o hotărâre prin care se stabilea că steagul secuiesc va fi utilizat cu ocazia unor manifestări de interes local, în acţiuni protocolare sau festive, alături de drapelul naţional. Hotărârea a fost atacată în instanţă, însă Tribunalul Harghita a respins cererea de anulare a hotărârii, pe motiv că semnele utilizate pe steag nu sunt caracteristice vreunei naţionalităţi.
Hotărârea Tribunalului Harghita a fost atacată cu recurs la Curtea de Apel Târgu Mureş, care a decis în 26 septembrie că hotărârea CJ Harghita nu este legală.
În motivarea Curţii de Apel Târgu Mureş se arată că "în ce priveşte critica recurentului vizând analizarea cererii sale, de către prima instanţă, în mod superficial, tribunalul neluând în considerare susţinerile sale concrete, referitoare la faptul că drapelul adoptat prin actul administrativ atacat este, în realitate, „drapelul secuiesc” şi la faptul că simbolurile incluse în drapel sunt caracteristice doar acestei colectivităţi, Curtea constată, pe de o parte, că, într-adevăr, prin cererea de chemare în judecată, reclamantul a formulat critici concrete în legătură cu adoptarea „drapelului secuiesc” şi a admis recursul formulat.
