Conform Administraţiei Bazinale de Apă Banat (ABAB) Timişoara, Spaţiul Hidrografic Banat (SHB) se situează pe locul al doilea la nivel naţional, în ceea ce priveşte zonele destinate pentru protecţia habitatelor şi speciilor.
Zonele unde menţinerea sau îmbunătăţirea stării apei reprezintă un factor important reprezintă 25% din suprafaţa SHB.
30 de zone ce au legătură cu apa, în Caraş-Severin şi Timiş
Acestea cuprind ariile naturale protejate de interes internaţional, comunitar, naţional şi local care au legătură cu apa. Zonele sunt reprezentate de ariile protejate din cadrul siturile Natura 2000 (SPA – arii de protecţie avifaunistică, SCI – situri de interes comunitar), de parcurile naturale, rezervaţiile naturale şi zonele protejate de interes local. În total sunt 30 de zone protejate pentru protecţia habitatelor şi speciilor care au legătură cu apa în SHB. De exemplu, zona Semenic – Cheile Caraşului este alcătuită din 3 rezervaţii ştiinţifice, un parc naţional, un SPA şi un SCI; zona Cheile Nerei – Beuşniţa este alcătuită din 4 rezervaţii ştiinţifice, un parc naţional, un SPA şi un SCI; zona Domogled – Valea Cernei este alcătuită din două rezervaţii naturale, un parc naţional, un SPA şi un SCI; zona Porţile de Fier este alcătuită din 4 rezervaţii naturale, un parc natural, un SPA şi un SCI; zona Mlaştina Satchinez este o rezervaţie naturală, un SPA şi un SCI; zona Aria naturală protejată Lacul Surduc este zonă protejată de interes local, zona Lunca Timişului reprezintă un SCI şi un SPA; zona Rusca Montană este o rezervaţie naturală şi un SCI; zona Munţii Ţarcu este un SCI. De asemenea, conform Administraţiei Bazinale de Apă Banat (ABAB) Timişoara, zonele vulnerabile la poluarea cu nitraţi din surse agricole sunt: Nera – Timişul Superior din care fac parte 50 de localităţi şi zona vulnerabilă Bega, judeţul Timiş, din care fac parte 85 de localită
