Mai mulţi lideri Al-Qaida au fost ucişi în întreaga lume, după moartea lui Osama bin Laden, la 2 mai 2011, printre care Abdelhamid Abu Zeid sau Mokhtar Belmokhtar, două figuri Al-Qaida din Magrebul Islamic (Aqmi) a căror moarte a fost anunţată de autorităţile din Ciad.
2011
- 2 mai: Osama Bin Laden este ucis în Pakistan după zece ani de căutări, într-o operaţiune a forţelor speciale americane, desfăşurată la reşedinţa din Abbottabad, unde bin Laden se ascundea, casă-fortăreaţă aflată apropiere de Islamabad. La 16 iunie, egipteanul Ayman Al-Zawahiri a fost desemnat să-l înlocuiască la conducerea organizaţiei.
- 8 iunie: Liderul Al-Qaida din Estul Africii, comorianul Fazul Abdullah Muhammad, unul dintre actorii principali ai atentatelor antiamericane din 1998 din Nairobi (Kenya) şi Dar es-Salaam (Tanzania), a fost ucis într-un schimb de focuri în Somalia.
- 22 august: Numărul doi din Al-Qaida, Atiyah abd al-Rahman este ucis în Pakistan, într-un atac american cu un avion fără pilot (dronă), în zona tribală Waziristan (nord-vest).
- 30 septembrie: Anwar al-Aulaqi, imam radical americano-yemenit, cu legături Al-Qaida, considerat inamic public de Washington, este ucis în Yemen într-un atac CIA cu drone. Aulaqi era bănuit de Washington de legături cu nigerianul Umar Faruk Abdulmutallab, autorul atentatului eşuat dintr-un avion de pasageri, din 25 decembrie 2009.
2012
- 9 februarie: Liderul Al-Qaida din Pakistan, Badar Mansoor, este ucis într-o ofensivă americană cu avioane fără pilot, în tabăra de antrenament de la Miranshah, principalul oraş din regiunea tribală Waziristanul de Nord.
- 6 mai: Un şef Al-Qaida din Peninsula Arabă (Aqpa), Fahd al-Quso, este ucis, în sudul Yemenului, într-un raid atribuit Statelor Unite. Fahd al-Quso era căutat de Statele Unite pentru implicarea în atacul împotriva USS Cole, în care au fost
