Fundația Greenpeace România a adresat patru plângeri către Comisia Europeană cu privire la construcții ilegale demarate în Parcuri Naționale și alte zone cu statut de protecție la nivel european din România.
Organizația a sesizat încălcarea directivelor europene în următoarele situații: extinderea unei cariere de piatră în Parcul Național Defileul Jiului (sit Natura 2000), construirea de microhidrocentrale în zona munților Făgăraș, tot pe teritoriul unei zone protejate Natura 2000, construcții ilegale în Parcul Natural Porțile de Fier, pe teritoriul a două zone protejate, defrișări ilegale derulate în pădurea Surlari, de lângă București, pentru a face loc autostrăzii București-Brașov. Autoritățile reclamate sunt Ministerul Mediului și Pădurilor, Ministerul Transporturilor, Compania Națională pentru Autostrăzi și Drumuri Naționale, Inspectoratul de Stat în Construcții și Romsilva.
În Parcul Natural Porțile de Fier și situl Natura 2000 de importanță comunitară, proprietarii terenurilor (atât persoane fizice cât și persoane juridice) au construit case și infrastructură turistică; în mod abuziv, pe titlurile de proprietate ale terenurilor respective este inclusă și albia Dunării, unde s-a construit ilegal, lucrările afectând iremediabil habitatul local.
În Parcul Național Defileul Jiului și în situl Natura 2000 este situată cariera de piatră Meri, care a funcționat inițial pe 9 hectare de teren, în partea sudică a Parcului Național. Licența de funcționare a carierei a expirat în 2010, iar Agenția de Protecția Mediului a refuzat să prelungească licența, cariera situându-se într-o zonă protejată. Consiliul Științific al Parcului Național Defileul Jiului a refuzat, de asemenea, să ridice statutul de protecție pentru 67 de hectare din parc, necesare extinderii carierei. Din acest motiv compania care deține cariera a acționat în instanță Consiliul Științif