Benedict al XVI-lea a făcut curăţenie, în cei opt ani de pontificat, în diocezele afectate de scandaluri sexuale şi corupţie cum nu a făcut niciun alt papă înaintea sa, apreciază unii vaticanişti la momentul plecării Papei german.
Papa a acceptat demisia unui număr important de episcopi, în special în ultimele luni, ultimul exemplu fiind al cardinalului scoţian Keith O'Brien, acuzat de preoţi de "comportament nepotrivit".
Scandalurile au fost diferite, din Africa şi până în Asia, reflectând situaţii adesea critice. A fost vorba despre episcopi şi oficiali ai Bisericii demişi pentru muşamalizarea unor abuzuri de natură pedofilă în rândul clerului, dar şi pentru că au întreţinut relaţii cu femei sau au fost suspectaţi de corupţie şi diverse deturnări de fonduri.
Anumiţi episcopi au fost demişi, de asemena, pentru o atitudine de nesubordonare gravă sau pentru încălcarea doctrinei.
În opinia lui Marco Tosatti, un vaticanist de la cotidianul La Stampa, Papa a destituit în medie doi sau trei episcopi pe lună în timpul pontificatului său. Benedict al XVI-lea, un fost gardian al dogmei timp de 24 de ani în timpul pontificatului lui Ioan Paul al II-lea, studia cu atenţie dosarele în vederea numirii de noi epsicopi şi refuza candidaţii care nu corespundeau.
Marco Tosatti citează declaraţii ale nunţiului papal în Kîrgîzstan şi Tadjikistan, monseniorul Miguel Maury Buendia. "Nunţii papali aflaţi în post se întâlneau cu un episcop şi îi spuneau «Sfântul Părinte vă cere, pentru binele Bisericii, să demisionaţi». Aproape toţi, atunci când venea nunţiul, recunoşteau dezastrul şi acceptau să demisioneze. Doi sau trei au refuzat, iar Papa i-a demis", afirmă expertul.
Peste 50 de episcopi au fost demişi în virtutea unor erori grave prevăzute în Codul Canonic.
Începând din iunie 2010, Papa a găsit un colaborator deosebit de riguros în perso