Poluarea şi lucrările necontrolate ameninţă flora şi fauna din zonă Distrugerea habitatelor, exploatarea comercială prin colectarea de plante, vânat iraţional, braconaj şi poluare sunt principalele cauze ale dispariţiei speciilor de animale şi plante.

Conform studiilor,  din anii 1600,  a crescut progresiv rata de dispariţie a speciilor, odată cu creşterea populaţiei umane şi consumarea resurselor naturale. Activităţile umane au distrus habitatele iar poluarea, drenarea mlaştinilor, defrişarea pădurilor duc la distrugerea sau fragmentarea acestor medii de viaţă.  Diverse specii de floră şi faună protejate, care au fost inventariate în Parcul Naţional Defileul Jiului,  se află în acelaşi pericol ca şi speciile din alte zone ale lumii.

Mii de specii protejate inventariate

Un prim inventar al speciilor de floră şi faună cât şi al habitatelor ce se pot întâlni în Defileul Jiului a fost realizat în urma unei cercetări iniţiate în vederea elaborării “Studiului privind Constituirea Parcului Naţional Defileul Jiului”, apărut în anul 2004.  Conform acestor cercetări, parcul respectiv cuprinde 1142 de specii. Dintre acestea 441 sunt specii de faună din care 168 sunt specii protejate şi 701 specii de floră din care 35 sunt protejate atât la nivel naţional, cât şi internaţional. Dintre speciile de faună protejate, cele mai cunoscute sunt  ursul brun,  specie protejată la nivel naţional, cât şi internaţional, lupul, râsul şi  vidra. Ierbivorele sunt reprezentate de  căprior, cerb şi capra neagră.

Acvile şi şoimi călători

În ceea ce priveşte păsările protejate, în Parcul Naţional Defileul Jiului  se pot întâlni exemplare de cocoş de munte, acvilă de munte şi şoim călător. De asemenea, existenţa în zonă a calcarelor face ca parcul să fie populat de  vipera cu corn, specie endemică pentru zonă şi vipera comună