Guvernul Ponta 2 aduce schimbări nu doar la vârful ministerelor, unde sunt desemnaţi miniştri din rândul câştigătorilor scrutinului parlamentar, ci şi la nivel de organizare a portofoliilor. Ministerele au fost fie împărţite (Ministerul Educaţiei şi cel al Tineretului), fie au trecut întregi structuri în alte ministere sau chiar sub autoritatea premierului (cazul Afacerilor Europene).
Fostul Minister al Administraţiei şi Internelor a devenit Ministerul Afacerilor Interne, unde instituţia prefectului este finanţată de stat prin bugetul Ministerului. Activitatea prefectului funcţionează în subordinea Guvernului, fiind coordonată de premier. Totodată, Direcţia Generală de Informaţii şi Protecţie Internă (DGIPI) din cadrul Ministerului Administraţiei şi Internelor va fi reorganizată ca departament în cadrul Ministerului Afacerilor Interne. Portofoliul de la Interne a revenit PNL, iar în fruntea ministerului este Radu Stroe (63 de ani).
Fostul Minister al Dezvoltării Regionale şi Turismului a devenit Ministerul Dezvoltării Regionale şi Administraţiei Publice prin preluarea activităţii în domeniul administraţiei publice, a structurilor şi a instituţiilor specializate în acest domeniu de la fostul Minister al Administraţiei şi Internelor. Inspectoratul de Stat în Construcţii, coordonat până acum de premierul Ponta, trece la Ministerul Dezvoltării. Portofoliul de la Dezvoltare a revenit PSD şi este deţinut de Liviu Dragnea (50 de ani).
Ministerul Mediului are un ministru delegat pentru ape, păduri şi piscicultură
Fostul Minister al Mediului şi Pădurilor a devenit Ministerul Mediului şi Schimbărilor Climatice, prin preluarea structurilor specializate din domeniul pisciculturii de la Ministerul Agriculturii şi Dezvoltării Rurale şi a celor din domeniul schimbărilor climatice de la Ministerul Economiei, Comerţului şi Mediului de Afaceri. Portofoliul Mini